Integrated Genome Browser
| バージョン |
9 |
| プラットフォームs | |
| ライセンス | Open Source |
| カテゴリー | Scientific |
| より多くの情報
(出版社のウェブサイトにアクセス)
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ソフトウェアレビュー
主な機能
- GenBankやFASTAなどのさまざまなゲノムフォーマットをサポートしています
- アニメーションのズームやパンによるデータの操作
- QuickLoadサイトからゲノムにアクセスして読み込む
- データをさまざまなグラフ形式に変換する
- Dropboxを介して共同編集者とデータを共有する
- 追加機能のためのプラグインをインストールする
Integrated Genome Browser（IGB）は、大規模なゲノムデータセットを閲覧および探索するために使用されるオープンソースプログラムです。さまざまなデータ形式の表示、データとの対話、グラフの作成、画像としての情報の保存、共同編集者とのデータの共有を行うことができます。
IGBを使用すると、注釈や並び順からデータを表示できます。プログラムは、FASTA、BAM、BEDGRAPH、BigWIG、Cytoband、GenBankなどのさまざまな形式をサポートしています。データを取得して、データの違いを強調表示するための不一致グラフやカバレッジを表示するための深度グラフなど、さまざまなグラフ形式に変換できます。また、IGBのズームアニメーションやパンアニメーションを使用してデータと対話することもできます。
IGBを使用すると、QuickLoadサイトからゲノムにアクセスして読み込むことができます。 IGBは、スクリプトを使用して機能とワークフローの自動化を追加するためのプラグインサポートを備えた高度な機能を提供します。高品質のJPEG、PNG、またはSVG画像として公開する場合でも、共同作業者がプロジェクトにアクセスできるようにDropboxにデータを保存する場合でも、IGBはデータを共有するための高度な機能を提供します。
IGBは主に大学の研究者、生物学者、およびバイオインフォマティシャンによって使用されます。さまざまなゲノムデータフォーマットを開き、データを異なるグラフとして視覚化し、共同研究者とデータを共有するための高度なツールを提供します。残念なことに、プログラムは継続的開発のための交付金に依存しています。つまり、アプリケーションのサポートはいつでも中止される可能性があります。ただし、Integrated Genome Browserは、ゲノムデータの探索と分析を検討しているユーザー向けの、機能が豊富でカスタマイズ可能なプログラムです。
更新日：2016年6月29日
▶ プライマリファイル拡張子
▶ 使用されるその他のファイル拡張子 Integrated Genome Browser 9
| サポートされているファイルの種類 | |
|---|---|
| .BED | UCSC BED Annotation Track File |
| .GB | GenBank Data File |
| .FASTA | FASTA Sequence File |
| .DAS | DeltaMaster Analysis Session |
| .SGR | SGR Genome Data File |
| .FA | FASTA Formatted Sequence File |
| .USEQ | USeq Genome Data File |
| .FAS | FASTA Sequence File |
| その他の関連ファイル形式 |
|---|