.cram ファイル拡張子
ファイルの種類Compressed Alignment File
開発者 | EBI |
カテゴリー | データファイル |
フォーマット | Binary |
.CRAM オプション番号
欧州分子生物学研究所のアウトステーションであるEBIによって開発された圧縮アラインメントファイルフォーマット。 BWA、BBMap、BLATなどの短い読み取りアライナから生成された短いDNA配列読み取りアライメントを格納します。
より詳しい情報
CRAMファイル形式は、バイナリアライメント/マップ(BAM)ファイル形式に似ていますが、より優れたファイル圧縮と再構成された列指向のバイナリコンテナ形式を特徴としています。遺伝的ソフトウェアの分野でデータ量が増加するにつれて、CRAMフォーマットはアライメントデータのディスク占有面積を減らすように設計された。
ショートリードアラインメントは、ゲノム内のどこに由来するのかを解読するプロセスです。参照ゲノムはかなり大きく、参照ゲノムで完全に一致するものを常に探しているとは限らないため、これは困難になる可能性があります。ショートリードアライナを使用して、一致および一致に近いものを大量に検索します。シーケンスは非常に大きいので、ファイルサイズを管理しやすくするためには、CRAMのようなフォーマットで提供される圧縮が必要です。
開くプログラム CRAM ファイル
Windows |
|